Misión
Contribuir a mejorar la situación de salud del país y asumir un rol de liderazgo en el cambio del modelo atención, a través de una gestión eficiente de los recursos, centrada en la satisfacción de las necesidades de los usuarios.
En lo asistencial ser el Hospital de Referencia Nacional de 2° y 3° nivel de complejidad, para la atención neonatal, pediátrica y gineco-obstétrica en el Sistema Integrado de Salud.
En lo docente ser el principal Centro de formación y capacitación de Recursos Humanos en el ámbito de las especialidades que se desarrollan a este nivel.
En lo Científico desarrollar planes de investigación en el marco de las actividades asistenciales específicas y en los problemas prioritarios de salud.
En lo social, ser reconocido como un bien nacional, por las características y calidad de los servicios prestados, y participar en forma conjunta con organizaciones sociales en acciones de fortalecimiento a nivel comunitario.

Visión
Ser un Centro Hospitalario de Referencia Nacional, para la atención de alta y mediana complejidad, en pediatría y gineco-obstetricia, que desarrolle sus actividades con el mejor nivel de calidad acorde con el desarrollo científico y social, en el marco del Sistema Nacional Integrado e Integral de Salud.